北交所拥有区别于沪深市场独立的交易制度，整体波动更大、交易门槛更高，交易费用由券商佣金、印花税、过户费、交易所经手费共同组成，想要参与交易，需要先开通合格投资者权限，充分熟悉竞价机制与完整成本结构，避免因规则盲区产生亏损。北交所投资者准入设置硬性条件，需要满足二十个交易日证券资产日均50万元，同时具备两年以上证券交易经验，不满足条件的普通投资者无法直接交易北交所个股，只能通过北交所相关ETF间接布局，这也是很多新手容易忽略的前置条件。
北交所核心交易规则包含交易时段、涨跌幅、申报机制三大板块。交易时间分为开盘集合竞价9:15-9:25，9:20至9:25阶段只能挂单不能撤单；9:30-11:30、13:00-14:57为连续竞价；14:57至15:00是收盘集合竞价，无法撤单。常规交易日股票涨跌幅限制为30%，新股上市首日、退市整理首日不设涨跌幅，价格相对开盘价波动达到30%、60%会触发临时停牌，单次停牌十分钟。连续竞价阶段存在价格笼子机制，买入申报不能高于基准价105%，卖出申报不能低于基准价95%，超出区间申报直接失效。申报数量最低100股，可1股递增，不足100股的零碎股需要一次性卖出。单笔达到10万股或者金额100万元以上，可以采用大宗交易。
北交所各项交易费用分为固定规费与可协商佣金两类。固定费用标准全市场统一，印花税仅卖出单边收取，费率为成交金额0.5‰；过户费双向收取，费率0.01‰；交易所经手费双向收取0.125‰，一般内嵌在券商佣金中，不会单独列示。券商佣金实行上限管理，最高不超过成交金额3‰，设有最低5元收费标准，佣金分为全佣与净佣，净佣模式下经手费额外叠加，投资者开户时需要和券商确认佣金类型。很多交易者容易混淆成本结构，频繁短线操作时，持续累积的手续费会大幅侵蚀收益，相比沪深主板，北交所综合交易成本更高，并不适合超短线频繁换手。
不少交易者习惯高波动品种，北交所30%涨跌幅容易吸引资金参与，但要区分证券市场与加密市场的本质差异，北交所受到严格监管，不存在24小时交易、杠杆合约等机制。同时需要警惕市场误区，不要把北交所股票类比虚拟货币炒作，应当严格遵守交易规则，合理测算交易成本。在交易前查看交割单，核对佣金、各项规费明细，根据自身持仓周期控制交易频率，以此降低手续费带来的损耗。
